01
2024年5月1日,西湖大學(xué)工學(xué)院朱博文團(tuán)隊(duì)以及合作者開發(fā)了一種人工脈沖視覺(jué)神經(jīng)元,能夠?qū)崿F(xiàn)外部視覺(jué)信息的速率與時(shí)間融合編碼。視覺(jué)神經(jīng)元通過(guò)單片集成氧化銦(In2O3)突觸光電晶體管和氧化鈮(NbOx)莫特憶阻器構(gòu)成,分別模擬了生物感光細(xì)胞和視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞的功能。采用速率-時(shí)間融合(Rate and Time Fusion, RTF)編碼方案的脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(SNN)可以通過(guò)模仿生物視覺(jué)提高人工視覺(jué)的處理效率。相關(guān)研究工作以“An artificial visual neuron with multiplexed rate and time-to-first-spike coding”為題發(fā)表于Nature Communications。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-48103-9
02
2024年5月2日,西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽(yáng)能燃料中心段樂(lè)樂(lè)團(tuán)隊(duì)在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“[2+1] Cycloadditions Modulate the Hydrophobicity of Ni-N4 Single-Atom Catalysts for Efficient CO2 Electroreduction”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)[2+1]環(huán)加成反應(yīng)實(shí)現(xiàn)了Ni-N4單原子催化劑的表面氟化,得到的超疏水Ni-N4-CF2催化劑在0.50 M KHCO3電解液中催化CO2還原時(shí)表現(xiàn)出近乎100%的FECO。該研究為Ni-N4 SACs的[2+1]環(huán)加成表面官能化提供了指導(dǎo),為通過(guò)共價(jià)表面官能化修飾碳材料負(fù)載金屬催化劑的微環(huán)境提出了新策略。
論文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202405650
03
2024年5月2日,西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院徐和平課題組與合作團(tuán)隊(duì)于Nature Immunology雜志發(fā)表題為"Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates"的研究論文。研究成果揭示了漿細(xì)胞形成的動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制以及TIGIT分子的新功能。通過(guò)構(gòu)建骨髓嵌合體小鼠等經(jīng)典免疫學(xué)模型,他們的研究發(fā)現(xiàn)TIGIT缺陷型漿細(xì)胞的增殖能力以及抗體分泌能力出現(xiàn)了顯著性的下降。這些研究結(jié)果表明作為抑制T細(xì)胞活化應(yīng)答的受體分子,TIGIT反而具有促進(jìn)漿細(xì)胞應(yīng)答的細(xì)胞內(nèi)在分子功能。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41590-024-01831-y
04
2024年5月5日,西湖大學(xué)工學(xué)院周南嘉團(tuán)隊(duì)提出了一種模塊化策略設(shè)計(jì)擠出頭,利用多材料直寫工藝擠出具有可調(diào)控周期性結(jié)構(gòu)的纖維,并用來(lái)制造具有空間可編程周期性結(jié)構(gòu)的 3D 物體。該研究成果以“Multimaterial extrusion of programmable periodic filament structures via modularly designed extruder heads”為題發(fā)表Additive Manufacturing上。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1016/j.addma.2024.104234
05
2024年5月6日,西湖大學(xué)理學(xué)院胡鵬飛課題組在JACS發(fā)表了題為“Divergent Synthesis of Scabrolide A and Havellockate via an?exo-exo-endo?Radical Cascade”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)利用高效的自由基串聯(lián)環(huán)化,通過(guò)一個(gè)共同中間體,完成兩個(gè)天然產(chǎn)物scabrolide A和havellockate的發(fā)散式合成,為呋喃丁烯內(nèi)酯(降)西松烷型二萜類分子的合成提供了新的思路。
論文鏈接:
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c03995
06
2024年5月9日,西湖大學(xué)理學(xué)院張?chǎng)螆F(tuán)隊(duì)在JACS上發(fā)表了題為“l(fā)onic effect on the microenvironment of biomolecular condensates”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用熒光壽命成像技術(shù),針對(duì)離子對(duì)生物凝聚體微環(huán)境的影響進(jìn)行了定量分析,并進(jìn)一步探究了離子對(duì)于多相凝聚體分層混溶狀態(tài)以及凝聚體對(duì)生物分子招募的影響。該成果系統(tǒng)研究了不同種類離子對(duì)生物凝聚體微環(huán)境性質(zhì)的影響,為細(xì)胞在響應(yīng)環(huán)境變化時(shí)調(diào)控凝聚體微環(huán)境提供了潛在途徑。
論文鏈接:
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jacs.4c04036
07
2024年5月10日,西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院鄭鉅圣團(tuán)隊(duì)與合作者于Gut發(fā)表了以腸道真菌與妊娠健康為主題的研究成果,題目為"Landscape of the gut mycobiome dynamics during pregnancy and its relationship with host metabolism and pregnancy health"。該研究基于大規(guī)模孕婦隊(duì)列(4800例),整合膳食調(diào)查、臨床檢查以及真菌組、細(xì)菌組、代謝組等數(shù)據(jù),全面描繪了影響腸道真菌組成與結(jié)構(gòu)的影響因素及其在孕期的動(dòng)態(tài)變化,并分析了腸道真菌與宿主代謝及妊娠健康的關(guān)聯(lián)及潛在機(jī)制,從腸道真菌的角度為全面理解腸道微生物對(duì)健康妊娠的影響提供了重要見(jiàn)解。
論文鏈接:
https://gut.bmj.com/content/early/2024/05/09/gutjnl-2024-332260
08
2024年5月17日,西湖大學(xué)理學(xué)院嚴(yán)正課題組與合作者的研究成果以“Measuring the Boundary Gapless State and Criticality via Disorder Operator”為題,發(fā)表在Physical Review Letters上,并被選為編輯推薦。嚴(yán)正團(tuán)隊(duì)與合作者通過(guò)設(shè)計(jì)邊緣的無(wú)序算符,成功提取了奇特的表面臨界信息,并且驗(yàn)證了他們所提出的理論猜想。這一研究成果開辟了有效提取多模式耦合下場(chǎng)論信息的新路徑,為表面臨界和非局域測(cè)量等領(lǐng)域提供了新思路。
論文鏈接:
https://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.132.206502
09
2024年5月17日,西湖大學(xué)工學(xué)院楊健團(tuán)隊(duì)報(bào)道了首個(gè)同時(shí)具有pH誘導(dǎo)變色、pH誘導(dǎo)開啟熒光和自毀行為的有機(jī)小分子高酞酸酐(HA),并利用其特性,將其與另外兩種pH指示劑結(jié)合,開發(fā)了一種具有動(dòng)態(tài)多維和多模式光學(xué)加密特性的CMY調(diào)色板,相關(guān)研究工作以“Harnessing the Duality of Bases Towards Controlled Color and Fluorescence”為題在線發(fā)表于Science Advances。
論文鏈接:
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adn9692
10
2024年5月19日,西湖大學(xué)工學(xué)院袁鑫實(shí)驗(yàn)室提出了一種基于CNN-Transformer架構(gòu)的高效、大尺度視頻單曝光壓縮成像重建算法EfficientSCI++。相關(guān)工作以“Hybrid CNN-Transformer Architecture for Efficient Large-Scale Video Snapshot Compressive Imaging”為題發(fā)表于計(jì)算機(jī)視覺(jué)頂刊International Journal of Computer Vision。
論文鏈接:
https://link.springer.com/article/10.1007/s11263-024-02101-y
11
2024年5月20日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李波團(tuán)隊(duì)于?Nature Communications?發(fā)表題為"Area postrema neurons mediate interleukin-6 function in cancer cachexia"的文章。研究人員發(fā)現(xiàn)腦干AP為介導(dǎo)IL-6參與腫瘤惡病質(zhì)的重要核團(tuán)。循環(huán)系統(tǒng)內(nèi)IL-6作用并激活A(yù)P神經(jīng)元;敲低AP神經(jīng)元內(nèi)IL-6受體可緩解惡病質(zhì)病癥并延長(zhǎng)壽命。該文章首次揭示腫瘤如何通過(guò)炎癥因子作用于神經(jīng)系統(tǒng),進(jìn)而引發(fā)惡病質(zhì),并闡釋了相關(guān)靶點(diǎn)與多種療法。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-48971-1
12
2024年5月22日,西湖大學(xué)工學(xué)院陸啟陽(yáng)研究員在國(guó)際期刊ACS Nano上以Nano Focus Article的形式發(fā)表了一篇題為“How to Correctly Analyze 2p X-ray Photoelectron Spectra of 3d Transition-Metal Oxides: Pitfalls and Principles”的教程(Tutorial)文章。該論文針對(duì)3d過(guò)渡金屬氧化物(如Mn、Fe、Co、Ni等)的2p X射線光電子光譜(X-ray photoelectron spectroscopy, 下文簡(jiǎn)稱XPS)的分析方法進(jìn)行了深入探討,指出了目前常用的分峰擬合和結(jié)合能位移方法在定量分析金屬氧化態(tài)方面存在的問(wèn)題,并建議使用基于電子結(jié)構(gòu)的理論框架來(lái)重構(gòu)從而理解2p XPS光譜的復(fù)雜性。
論文鏈接:
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.4c03964
13
2024年5月31日,西湖大學(xué)理學(xué)院石航課題組在JACS發(fā)表了題為“Ruthenium/η5-Phenoxo-Catalyzed Amination of Phenols with Amines”的研究論文。石航團(tuán)隊(duì)針對(duì)已知釕催化劑吸電子能力弱而難以通過(guò)π配位活化苯酚的問(wèn)題,發(fā)展了η5-phenoxo配位的二價(jià)釕催化劑,實(shí)現(xiàn)了釕催化苯酚與胺的脫水縮合胺化反應(yīng)。
論文鏈接:
https://pubs.acs.org/doi/epdf/10.1021/jacs.4c02089
14
2024年5月31日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院賈潔敏團(tuán)隊(duì)在Journal of Cerebral Blood Flow & Metabolism發(fā)表題為"High-resolution vasomotion analysis reveals novel arteriole physiological features and progressive modulation of cerebral vascular networks by stroke"的研究論文,他們提出了一項(xiàng)全面系統(tǒng)的血管動(dòng)力學(xué)分析算法,不僅僅描述了生理狀況下小鼠腦動(dòng)脈血管運(yùn)動(dòng)的基本特征,并實(shí)時(shí)記錄分析(0-14 days)缺血性中風(fēng)條件下小鼠腦動(dòng)脈血管運(yùn)動(dòng)與腦血流遭遇的損傷及其恢復(fù)情況,最終通過(guò)轉(zhuǎn)基因(ME-Linker)小鼠重新激活腦動(dòng)脈的自發(fā)血管運(yùn)動(dòng),實(shí)現(xiàn)最佳再灌注的同時(shí)改善神經(jīng)損傷,以助于缺血性中風(fēng)后腦血管的恢復(fù)。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1177/0271678X241258576
15
2024年6月17日至6月21日,人工智能頂級(jí)會(huì)議CVPR 2024于美國(guó)西雅圖舉行。在CVPR 2024公布的錄取結(jié)果中,西湖大學(xué)工學(xué)院人工智能方向的李子青實(shí)驗(yàn)室、王東林實(shí)驗(yàn)室、袁鑫實(shí)驗(yàn)室、藍(lán)振忠實(shí)驗(yàn)室、劉沛東實(shí)驗(yàn)室、林濤實(shí)驗(yàn)室、于開丞實(shí)驗(yàn)室共有9篇成果入選,其中2篇入選Poster(Highlight)論文。除此之外,原發(fā)杰實(shí)驗(yàn)室有1篇論文被人工智能國(guó)際頂刊TPAMI錄用。
近期,第42屆國(guó)際機(jī)器學(xué)習(xí)大會(huì) ICML 2024 公布錄用結(jié)果,組委會(huì)于9473 篇論文中錄用了2609篇論文(中稿率為27.5%),據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),有12篇來(lái)自西湖大學(xué)工學(xué)院人工智能方向的高水平論文成功入選。12篇?ICML 2024 論文中,有2篇來(lái)自王東林實(shí)驗(yàn)室,10篇來(lái)自李子青實(shí)驗(yàn)室。研究成果涉及 Al for Science、強(qiáng)化學(xué)習(xí)、擴(kuò)散模型、長(zhǎng)序列建模、生物分子設(shè)計(jì)等的相關(guān)領(lǐng)域。
16
近日,第62屆國(guó)際計(jì)算語(yǔ)言學(xué)年會(huì)(Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics,簡(jiǎn)稱 ACL)公布了 ACL 2024 論文錄用消息。西湖大學(xué)工學(xué)院人工智能方向共9篇論文被 ACL 2024 錄用,其中3篇論文被 ACL 主會(huì)錄用,6篇被 Findings of ACL 錄用。ACL年會(huì)是計(jì)算語(yǔ)言學(xué)和自然語(yǔ)言處理領(lǐng)域國(guó)際排名第一的頂級(jí)學(xué)術(shù)會(huì)議,由國(guó)際計(jì)算語(yǔ)言學(xué)協(xié)會(huì)組織,每年召開一次,在中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)(CCF)推薦會(huì)議列表中被列為A類會(huì)議。2024年是第62屆會(huì)議,將于8月11日至8月16日在泰國(guó)曼谷舉行。
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2024年6月8日,西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽(yáng)能燃料中心孫立成團(tuán)隊(duì)在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“Poly(Dibenzothiophene-Terphenyl Piperidinium) for High-performance Anion Exchange Membrane Water Electrolysis”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)從陰離子交換膜(AEM)傳質(zhì)機(jī)理出發(fā),基于增強(qiáng)Grotthuss傳質(zhì)機(jī)理的設(shè)計(jì)思路,開發(fā)了一種用于水電解的高性能陰離子交換膜,為AEM乃至其他離子交換膜的性能提升提供更多可能,加速了AEM電解水的產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1002/anie.202405738
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2024年6月12日,西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽(yáng)能燃料中心王濤實(shí)驗(yàn)室在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“Rational Understanding Hydroxide Diffusion Mechanism in Anion Exchange Membranes during Electrochemical Processes with RDAnalyzer”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)反應(yīng)分子動(dòng)力學(xué)模擬對(duì)氫氧根在AEM中的擴(kuò)散機(jī)理進(jìn)行了探究,通過(guò)自主開發(fā)的RDAnalyzer軟件實(shí)現(xiàn)了不同擴(kuò)散機(jī)理的高效解耦和拆分,最終得到了Free Vehicular、Free Grotthuss、Associated Vehicular和Associated Grotthuss四種機(jī)理對(duì)于氫氧根擴(kuò)散速率的貢獻(xiàn)。該工作為研究氫氧根在AEM中的擴(kuò)散機(jī)制提供了理論新策略和機(jī)理分析新工具。
論文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202403614
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2024年6月17日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院蔡尚團(tuán)隊(duì)在Nature Communications雜志在線發(fā)表了以衰老和乳腺癌發(fā)生為主題的研究成果:“Progressive Senescence Programs Induce Intrinsic Vulnerability to Aging-related Female Breast Cancer”。這項(xiàng)工作在單細(xì)胞層面建立了乳腺干細(xì)胞在小鼠全生命周期自然衰老過(guò)程中的分子時(shí)鐘,揭示了衰老干細(xì)胞的多態(tài)性及漸進(jìn)性,同時(shí)構(gòu)建了正常細(xì)胞經(jīng)衰老進(jìn)而癌化的潛在途徑,闡明了衰老轉(zhuǎn)化過(guò)程中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),并成功篩選到通過(guò)抑制衰老降低癌發(fā)幾率的小分子抑制劑。該研究對(duì)降低衰老人群的乳腺癌發(fā)生率提供了理論框架及潛在的干預(yù)策略。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-49106-2
20
2024年6月17日,西湖大學(xué)工學(xué)院朱博文課題組和合作者提出了一種具有離子介導(dǎo)功能的化學(xué)響應(yīng)脈沖神經(jīng)元,用于模擬生物神經(jīng)元的行為,為構(gòu)建未來(lái)的生物混合神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提供了一種新的策略,相關(guān)研究工作以“An Ion-Mediated Spiking Chemical Neuron based on Mott Memristor”為題發(fā)表于Advanced Materials。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adma.202403678
21
近期,西湖大學(xué)工學(xué)院劉剴實(shí)驗(yàn)室與合作伙伴在Advanced Materials、Advanced Functional Materials以及Water Research發(fā)表三項(xiàng)研究成果。一方面,課題組通過(guò)研究微塑料(NMPs)類新污染物從陸地到河流系統(tǒng)的傳輸途徑,發(fā)現(xiàn)重點(diǎn)管控全國(guó)部分區(qū)域可實(shí)現(xiàn)NMPs污染的有效控制;另一方面,通過(guò)研究熔融鹽向單原子位點(diǎn)轉(zhuǎn)化的形成機(jī)制,構(gòu)建具有普適性的單原子催化劑(SACs)制備策略,用于環(huán)境與能源催化;并通過(guò)原位譜學(xué)、電化學(xué)手段闡明SACs加氫機(jī)制,實(shí)現(xiàn)二氧化碳向高價(jià)值化工原料高效轉(zhuǎn)化。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.watres.2024.121597
論文鏈接:https://doi.org/10.1002/adma.202406380
論文鏈接:https://doi.org/10.1002/adfm.202405835
22
2024年6月25日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院甄瑩團(tuán)隊(duì)在PNAS Nexus雜志在線發(fā)表了螢火蟲毒素的起源演化的研究成果:“Firefly toxin lucibufagins evolved after the origin of bioluminescence”。通過(guò)比對(duì)產(chǎn)生LBGs毒素的螢火蟲和不產(chǎn)生毒素的螢火蟲ATPα氨基酸序列,團(tuán)隊(duì)研究人員找到疑似的氨基酸耐受突變,它們會(huì)不同程度影響毒素和蛋白的結(jié)合,從分子耐受性角度解釋了螢亞科螢火蟲善假于毒的能力。
論文鏈接:
https://academic.oup.com/pnasnexus/article/3/6/pgae215/7695494
23
2024年6月19日,西湖大學(xué)理學(xué)院劉志常實(shí)驗(yàn)室在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“π-Diamond: A Diamondoid Superstructure Driven by π-Interactions”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)利用分子張力工程策略,構(gòu)建了Z形三面板組裝基元,僅利用純?chǔ)?相互作用實(shí)現(xiàn)了金剛石超結(jié)構(gòu)的分層自組裝。這一研究探索了非共價(jià)相互作用的新可能性,為功能化超結(jié)構(gòu)的構(gòu)筑和材料科學(xué)帶來(lái)了新的發(fā)展前景。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202409507
24
2024年7月2日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院裴端卿實(shí)驗(yàn)室在Cell Discovery發(fā)表題為“Pig blastocyst-like structure models from embryonic stem cells”的研究論文,該研究建立了將豬胚胎干細(xì)胞誘導(dǎo)為類囊胚的技術(shù)體系,首次將豬胚胎干細(xì)胞誘導(dǎo)形成類囊胚模型。豬是重要的畜牧業(yè)動(dòng)物,也是理想的疾病模型,更是人源化器官的潛在供體。該研究可為改善豬等家畜大動(dòng)物的育種體系、加速優(yōu)良品種培育的進(jìn)程提供新的思路,為探究人-豬細(xì)胞間相互作用提供優(yōu)良體外模型,有助于推進(jìn)在豬體內(nèi)產(chǎn)生人源器官的研究進(jìn)程。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41421-024-00693-w
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近期,機(jī)器人頂會(huì)RSS收錄王東林實(shí)驗(yàn)室成果,該文提出了一種基于RL的快速在線自適應(yīng)控制(RL2AC)策略,以增強(qiáng)未知環(huán)境下足式機(jī)器人運(yùn)動(dòng)的魯棒性。通過(guò)在RL中加入了一個(gè)自適應(yīng)的前饋補(bǔ)償項(xiàng),以應(yīng)對(duì)各種不確定因素對(duì)RL策略的影響。該論文被國(guó)際機(jī)器人頂級(jí)會(huì)議Robotics: Science and Systems(RSS)接收(2024年全球僅收錄135篇)。
RSS 2024接收論文列表詳見(jiàn):https://roboticsconference.org/program/papers/
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2024年7月1日,西湖大學(xué)工學(xué)院王睿團(tuán)隊(duì)以及合作者在Nature Photonics上發(fā)表題為“High-entropy hybrid perovskites with disordered organic moieties for perovskite solar cells”的研究成果。他們首次探索了有機(jī)組分在構(gòu)建新型高熵材料中的潛力,成功開發(fā)了一系列高熵有機(jī)-無(wú)機(jī)雜化鈣鈦礦材料,并深入探索了高熵有機(jī)-無(wú)機(jī)雜化鈣鈦礦材料的結(jié)構(gòu)特征,揭示了其獨(dú)特的體系熵貢獻(xiàn)機(jī)制,為新型高熵材料的研發(fā)提供了全新的理論基礎(chǔ),同時(shí)為進(jìn)一步提高光伏器件的性能提供了全新的材料選擇。
論文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41566-024-01468-1
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2024年7月10日,在意大利拉奎拉舉行的國(guó)際暗物質(zhì)大會(huì)(IDM)上,XENON合作組發(fā)布了首次測(cè)量到太陽(yáng)中微子的低能核反沖信號(hào)的結(jié)果。這些中微子來(lái)自太陽(yáng)內(nèi)部的核反應(yīng),即涉及硼元素的反應(yīng)鏈。西湖大學(xué)理學(xué)院物理系李圣超團(tuán)隊(duì)代表西湖大學(xué)參加X(jué)ENON暗物質(zhì)實(shí)驗(yàn)國(guó)際合作組,是探測(cè)器刻度工作的責(zé)任單位。在XENONnT尋找太陽(yáng)硼-8中微子的實(shí)驗(yàn)中,李圣超博士帶領(lǐng)中外團(tuán)隊(duì)成員進(jìn)行了對(duì)中微子核反沖信號(hào)的刻度研究。利用釔-鈹源產(chǎn)生的光中子,這一研究確定了液氙在低動(dòng)量轉(zhuǎn)移下核反沖的信號(hào)特征,對(duì)理解接近探測(cè)器靈敏極限的微弱中微子信號(hào)提供依據(jù),為此項(xiàng)突破成果作出顯著貢獻(xiàn)。
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2024年7月15日,西湖大學(xué)工學(xué)院鞠峰團(tuán)隊(duì)以“Highly-Accurate Classification and Discovery of Microbial Protein Functions Using FunGeneTyper: An Extensible Deep Learning Framework”為題在Briefings in Bioinformatics在線發(fā)表研究成果。研究團(tuán)隊(duì)首次提出了一個(gè)兼具蛋白編碼功能基因的精準(zhǔn)分類與發(fā)現(xiàn)雙重功能的可擴(kuò)展深度學(xué)習(xí)框架 FunGeneTyper, 并以威脅人類健康的抗生素抗性基因(ARG)為例,利用該新框架開發(fā)了相應(yīng)的ARG精準(zhǔn)分類器ARGTyper,比現(xiàn)有工具表現(xiàn)出更好的ARG分類性能。研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步利用從不同生境獲得的實(shí)際微生物宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)測(cè)試展示了該新框架在新的功能基因發(fā)現(xiàn)任務(wù)上的明顯優(yōu)越性,并通過(guò)遷移學(xué)習(xí)證明了該框架在細(xì)菌毒力基因(VFG)等其他類型功能基因的精準(zhǔn)分類與發(fā)現(xiàn)方面具有普適性。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1093/bib/bbae319
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2024年7月16日,西湖大學(xué)理學(xué)院吳明軒團(tuán)隊(duì)在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“A Chemoselective Enrichment Strategy for In-Depth Coverage of the Methyllysine Proteome”的研究成果。研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于芳基重氮鹽共價(jià)、高效且可逆標(biāo)記單甲基化賴氨酸的方法,成功實(shí)現(xiàn)了在多種生物樣本中對(duì)賴氨酸甲基化修飾進(jìn)行廣泛的富集和鑒定,極大地拓展了領(lǐng)域內(nèi)對(duì)賴氨酸甲基化修飾的認(rèn)知,并為進(jìn)一步研究賴氨酸甲基化修飾提供了一種有效便捷的化學(xué)工具。
論文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202408564
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2024年7月16日,西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽(yáng)能燃料中心孫立成實(shí)驗(yàn)室在Nature Communications發(fā)表題為“Closing Kok’s cycle of nature’s water oxidation catalysis”的研究成果。他們利用GPU加速的分子動(dòng)力學(xué)模擬和量子化學(xué)計(jì)算,發(fā)現(xiàn)了天然水氧化催化劑的重構(gòu)過(guò)程。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-50210-6
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2024年7月23日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院裴端卿課題組在Nature Communications在線發(fā)表題為Engineering mouse cell fate controller by rational design的文章。盡管目前對(duì)染色質(zhì)動(dòng)態(tài)變化規(guī)律和功能已有較為深入的研究,但如何通過(guò)開發(fā)相應(yīng)工具調(diào)節(jié)染色質(zhì)可及性達(dá)到誘導(dǎo)細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變?nèi)杂写M(jìn)一步闡明。該研究通過(guò)工程化改造轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控染色質(zhì)可及性實(shí)現(xiàn)細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變并闡明其作用機(jī)制。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-50551-2
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近日,歐洲計(jì)算機(jī)視覺(jué)國(guó)際會(huì)議ECCV 2024公布了論文的收錄結(jié)果。西湖大學(xué)工學(xué)院人工智能方向共16篇論文入選。ECCV,全稱為European Conference on Computer Vision,即歐洲計(jì)算機(jī)視覺(jué)國(guó)際會(huì)議,是計(jì)算機(jī)視覺(jué)領(lǐng)域中最頂級(jí)的會(huì)議之一,與ICCV(International Conference on Computer Vision)和CVPR(Conference on Computer Vision and Pattern Recognition)并稱為計(jì)算機(jī)視覺(jué)領(lǐng)域的“三大頂會(huì)”。
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2024年7月29日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院裴端卿實(shí)驗(yàn)室在Nature?Communications發(fā)表題為“Cell fate decision by a morphogen-transcription factor-chromatin modifier axis”的研究論文,該研究報(bào)道了“胞外形態(tài)發(fā)生素信號(hào)分子-核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子-染色質(zhì)重塑復(fù)合物”細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控新范式,提供了一種研究早期胚胎發(fā)育過(guò)程中Epiblast-Hypoblast細(xì)胞命運(yùn)決定的體外模型,并且首次建立了小鼠iPrE(induced Primitive Endoderm)體外誘導(dǎo)新方法。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-50144-z
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2024年7月29日,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院蔣敏課題組在Nature Aging發(fā)表題為“Maternal age enhances purifying selection on pathogenic mutations in complex I genes of mammalian mtDNA”的研究論文。該文使用最新的線粒體基因組編輯工具DdCBEs,成功構(gòu)建了兩種與臨床線粒體疾病病人致病位點(diǎn)同源的單點(diǎn)突變小鼠模型,均為呼吸鏈復(fù)合物I亞單位:m.2820 G>A(ND1)和m.12918 G>A(ND5)。通過(guò)對(duì)這兩種小鼠模型的母源遺傳模式的研究,發(fā)現(xiàn)了這兩個(gè)突變位點(diǎn)在母系遺傳過(guò)程中被強(qiáng)力純化選擇,即:高突變的媽媽能夠生出遠(yuǎn)低于自身突變率的下一代。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s43587-024-00672-6
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